История Театра юного зрителя РС (Я) начинается с 1990 года, когда был создан Театр эстрадных миниатюр «Наара суохтар» («Бесшабашные») при Якутской государственной филармонии.
С 1992 по 2000 год — Государственный национальный театр эстрадных миниатюр «Наара суохтар». С 2000 года переименован в Государственный театр юмора и сатиры Республики Саха (Якутия). С 2008 года переименован в ГУ «Театр юного зрителя Республики Саха (Якутия)». В декабре 2011 года театр переименован в ГБУ РС (Я) «Театр юного зрителя».
Вдохновителями и основателями театра являются директор театра — заслуженный работник культуры РС (Я) Матрена Степановна Павлова и художественный руководитель — заслуженный работник культуры Российской Федерации, народный артист РС (Я) Алексей Прокопьевич Павлов.